Johann blev gift med Catharina Görries den 23 nov. 1663. Catharina (datter af Bendix Görries og Cecilia Pranger) blev født cirka 1640 i Itzehoe, Holsten; døde den 3 okt. 1708 i Albersdorf, Ditmarsken; blev begravet den 17 okt. 1708 i Albersdorf. [Gruppeskema] [Familietavle]

1. Benedictus Messner blev født den 23 okt. 1664 i Albersdorf, Ditmarsken; blev døbt den 27 okt. 1664 i Albersdorf; døde den 26 apr. 1734 i Albersdorf, Ditmarsken; blev begravet den 12 maj 1734 i Albersdorf.
2. Claus Albert Messner blev født den 30 apr. 1669 i Albersdorf; blev døbt den 7 maj 1669 i Albersdorf; døde den 14 aug. 1720.
3. Cecilie Margaretha Messner blev født den 6 nov. 1673 i Albersdorf, Ditmarsken; blev døbt den 13 nov. 1673 i Albersdorf; døde den 4 apr. 1703 i Albersdorf, Ditmarsken; blev begravet den 17 apr. 1703 i Albersdorf.